Η ανάθεση κρίσιμων αρμοδιοτήτων στην ΑΑΔΕ, δυστυχώς επιβεβαίωσε τις
αρχικές επιφυλάξεις με την απόφαση αυτή, για το ενδεχόμενο να οδηγήσει σε έλλειψη λογοδοσίας και πολιτικής ευθύνης, να δημιουργήσει σοβαρό κίνδυνο απώλειας ευρωπαϊκών κονδυλίων και να προκαλέσει διοικητικά κενά και μεγάλες δυσλειτουργίες.
Η ΑΑΔΕ αποτελεί πράγματι Ανεξάρτητη Αρχή. Δεν αποτελεί όμως ανεξέλεγκτο
θεσμό ούτε μπορεί η λειτουργική της ανεξαρτησία να οδηγεί σε θεσμικό κενό
πολιτικής ευθύνης ή σε αδυναμία άσκησης αποτελεσματικού κοινοβουλευτικού ελέγχου. Η ανεξαρτησία της Αρχής δεν απαλλάσσει την Κυβέρνηση από την ευθύνη να λογοδοτεί στη Βουλή για τις επιλογές της, ούτε μπορεί να χρησιμοποιείται ως άλλοθι προκειμένου να μην απαντώνται κοινοβουλευτικές ερωτήσεις που αφορούν τη διαχείριση δημόσιων και ευρωπαϊκών πόρων.
Η συνεχιζόμενη άρνηση όλων των αρμόδιων κυβερνητικών παραγόντων να αναλάβουν την ευθύνη απάντησης δημιουργεί εύλογα ερωτήματα για το ποιος τελικά ασκεί τον πολιτικό συντονισμό, ποιος εποπτεύει την εφαρμογή των κυβερνητικών αποφάσεων και ποιος λογοδοτεί απέναντι στην εθνική αντιπροσωπεία.